アプリケーションソフトウェア
整備するアプリケーション
SNPs高速探索のためのシークエンスマッチング
グラフマッチング
類似構造のタンパク質の比較・大規模検索が不可欠
必要技術
・ 立体構造比較
・ グラフ高速マッチング
・ 高速並列検索アルゴリズム
ゲノム解析
- DPによる単純マッチングから、グラフマッチングを用いた高次探索へ
- チップ超並列プロセッサによるグラフマッチングの高速化
質量分析器による、たんぱく質、代謝物の網羅的測定
- 1日数GB/台のデータ出力性能
- データ量はゲノム研究の1000倍以上
・ スペクトルピークのアライメント
・ スペクトルピークの検索
天体シミュレーション
- 惑星形成（下図）
- 銀河の誕生から現在まで
- 108個の粒子シミュレーション
- 現状では世界的にGRAPE-6が使われている
フリーメッシュ法による流体・構造解析
- メッシュ生成が不要で並列処理に有利
- EFGM等に比べて高精度
